但公司要扣我工资说我有损失，这怎么处理？

您可以向劳动行政部门投诉公司扣工资的行为。依据《劳动法》，单位无故克扣工资，劳动行政部门会责令补足，还可要求赔偿。若不及时处理，可能导致您的合法权益持续受损，且难以追回被扣工资。
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处理公司扣工资问题，常见方式有投诉、仲裁、诉讼。向劳动行政部门投诉要求补足工资；若投诉无果，可申请劳动仲裁；仍不解决，可提起劳动诉讼。选择时应考虑效率和成本，投诉较快且成本低，仲裁和诉讼耗时长但更具法律效力。
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离职被扣工资，处理方式如下：1.保留证据，如工资条、离职证明等；2.先尝试与公司沟通解决；3.沟通无果则向劳动行政部门投诉；4.投诉无果申请劳动仲裁；5.仲裁不服再提起劳动诉讼。